В конце XVI века возникает Запорожское войско, настоящий расцвет которого приходится на восстание Богдана Хмельницкого. Гетман сначала разбивает поляков, а потом и литовцев, направляя войско на освобождение Киева. «Я, Богдан Хмельницкий, гетьман Войска Запорожского и все войско Запорожское и весь мир христианский…вырву из лядцкой неволи весь народ русский» - именно такими словами Хмельницкий призывает казаков на войну.
Во время польско-литовской евроинтеграции появляется слово «оукрайна» - так польская шляхта называет оккупированные земли Руси. В летописях жители польского пограничья называются «ляхове оукраиняне». Это слово не имеет этнического или национального оттенка, а используется для обозначения жителей приграничных территорий. Здесь же к русскому языку постепенно прирастают польские слова.
Тем временем на севере, в ходе феодальной борьбы столицей Руси становится Москва. Под её знамёнами вновь собираются русские земли, возникает Русское Царство. В 1648 году Богдан Хмельницкий от имени Запорожского войска пишет письмо русскому царю Алексею Михайловичу Романову, и просит принять запорожцев в состав Русского Царства. Самонаименование «малороссы» расширяется с Запорожской Сечи на всех русских жителей присоединяемых территорий.
В 1654м году после Переяславской рады киевляне также приносят присягу царю Алексею Михайловичу. В Киеве размещают гарнизон из стрельцов, которые вместе с казаками удерживают город в ходе русско-польской войны. Киевский полковник В. Дворецкий называет «украинцами» правобережных казаков, обращаясь к ним как к пограничникам, удерживающим окрайные земли Руси. В отношении всего малороссийского населения он применяет понятия «народ рус(с)кий», «хртаяне русъкие», «русь», «козаки и вся русь». После победы Малая Русь воссоединяется с Русью Царской и образует единое государство, ставшее вскоре Российской империей.
В конце XVII века на политической сцене появляется Иван Мазепа. В начале политической карьеры Мазепу хотят убить запорожские казаки, но от расправы его спасают Дорошенко и гетман Самойлович. Желая всё больше денег и власти, Мазепа предаёт своих спасителей и переходит к князю Голицыну и Царевне Софье, которые ставят его гетманом Запорожской Сечи. Но Мазепа предаёт и их - встав на сторону Петра.
Во время Северной войны Мазепа совершает очередное предательство и встаёт на сторону ляхов в Северной войне против России, но запорожские казаки его не поддерживают. Мазепа уходит к Карлу XII с отрядом всего в две тысячи человек, но и при шведском престоле изменник не приживается, погрязнув в наговорах и интриганстве. После поражения в Северной войне, серийный предатель Мазепа вместе с остатками своего отряда позорно бежит к туркам. Запорожская сечь упраздняется указом ПетраI.
После раздела Речи Посполитой начинается активное инфраструктурное и промышленное развитие Малой Руси. Особо стоит отметить Екатерину Великую, которая упраздняет гетманщину и отбивает у турок Таврию и Бессарабию. Екатерина создаёт города Херсон, Одессу, Николаев, Луганск, Севастополь, Мариуполь, Запорожье и Днепропетровск - которые формируют Новороссийскую губернию. Вместе с новыми городами расцветают ремёсла, строительство, промыслы и малорусская культура. Киев становится одним из центров российской науки и купечества.
В это же время оказавшаяся на территории Российской империи польская шляхта, недовольная своим положением после раздела Польши, начинает пропагандировать идеи самостийности в западных землях Малороссии.